1952-1956年，全国院系调整，重庆大学除工学院部分专业外其他学部均遭到拆分，参与组建华西医科大学，四川大学，重庆建筑大学，西南交通大学，西南政法大学，成都科技大学，北京邮电大学等众多知名高校，重庆大学附属沙磁医院独立为重庆市肿瘤医院。

   1952年重大医学院调入当时的华西大学，即后来的华西医科大学，后来又被并入四川大学。

   1952年重大文学院并入四川大学，部分老师调入当时的西南师范学院。

   1952年重大铁道工程专业调入西南交通大学土木系。

   1952年重大商学院调入当时的西南财经学院和四川财经学院，即西南财经大学。

   1952年重大法学院组成当时的西南政法学院，即的西南政法大学。

   1952年重大体育系科调入西南师范学院，即西南师范大学（2005年7月与西南农业大学合并组建西南大学）

   1952年重大农业系科调入西南农学院，即西南农业大学（2005年7月与西南师范大学合并组建西南大学）

   1952年重大化学化工系调入四川化学工业学院即成都科技大学，后来又被并入四川大学。

   1952年重大的土木建筑组成后来的重庆建筑大学，重庆交通学院后又从建筑大学中分离，2000年重庆建筑大学重回重大。

   1953年重大理学院并入四川大学。

   1955年重大无线电系电报电话专业与天津大学两个专业组成北京邮电学院，即北京邮电大学。

   1956年在重大地质系的基础上成立四川地质学院，就是后来的成都理工大学。

   1952年调入重大有西南工业专科学校和川南工业学院机械科和电机科，石油专科学校钻探和机械科，西南工业部工业学校机械科。

   1952年调整中，文，商，法，医学院全部调入他校，工科专业有进有出，理学院暂时保留未动。 

   1952年9月20日，以何鲁教授为主任委员的重庆大学院系调整委员会开始着手搬迁事宜。从9月28日起，到11月19日，一个半月的时候，调整搬迁工作基本结束。但是对重庆大学的调整远没有结束。 

   1953年理学院全部调入四川大学，1955无线电系全部调出 ,1956地质系全部调出，1952大调整中，工学院是唯一保持了较强实力的学院，因为此时整个重大只剩下一个学院--工学院。工学院自身也受到重创，无线电系和地质系全部迁出，土木建筑系也全部迁出，1958年重大曾增设了国防科技专业的6个新系，1962年时这6个新系又被调整组合，重大仅保留了无线电专业。第一次调整后工学院所存在的6个专业为：机械制造系，动力系，电讯系，采矿系，冶金系，地质系。第二次调整后所设置专业为：机械制造系，动力系，电机系，采矿系，冶金系。至此，风雨飘摇中颠簸着艰险成长的重大只有5个专业。

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